在涉及经济犯罪或民事纠纷等案件中，法院经常需要调查涉案资金的流向，以查明事实真相并作出公正判决。那么，对于使用立刷POS机进行交易的商户而言，法院是否能够查询到这些POS机的资金流向呢？

首先，需要明确的是，法院作为司法机关，在依法行使职权时，有权获取与案件相关的证据和信息。因此，在涉及立刷POS机资金流向的调查中，如果法院认为有必要，可以依法向相关机构或部门发出查询通知，要求提供所需的资金流向数据。

具体而言，法院可以通过以下途径查询立刷POS机的资金流向：一是向立刷POS机的服务提供商或银行发出查询通知，要求其提供与涉案商户相关的交易记录和数据；二是通过调取涉案商户的银行账户信息，分析资金的流入流出情况；三是借助技术手段，如大数据分析、网络追踪等，对资金流向进行追踪和分析。

然而，需要注意的是，法院在查询立刷POS机资金流向时，必须遵守法律规定和程序要求，确保查询行为的合法性和正当性。同时，法院也应尊重商户的个人隐私和商业机密，避免过度干预和泄露敏感信息。

综上所述，法院在特定情况下有权查询立刷POS机的资金流向，但这一行为必须依法进行，并充分考虑个人隐私和商业机密的保护。通过合法途径获取资金流向数据，有助于法院查明案件事实，维护社会公平正义。